Первым деканом факультета был заведующий кафедрой “Физика” к.т.н., профессор Свистунов Б.Л., заместитель декана Лушникова Н.В.
Первыми кафедрами факультета, начавшими подготовку специалистов экономического профиля были: кафедра ”Экономика, финансы и менеджмент” (зав.кафедрой Будина В.И.) , кафедра “Экономическая кибернетика” (зав.кафедрой Федотов Н.Г.), кафедра “Государственное и муниципальное управление ” (зав. кафедрой Маркин В.В).
С образованием в структуре университета института государственной службы и управления (ИГСУ) - кафедра ГМУ стала его основой. На ФЭУ были переведены кафедра “Менеджмент” с МФ и кафедра “БУНиА” с ЮФ, образованы новые кафедры. В состав образованного естественнонаучного факультета была переведена кафедра “Физика” и ФЭУ окончательно принял чисто экономический профиль.
В 2002 г. деканом факультета был избран доктор экономических наук, профессор Виктор Михайлович Володин.